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北京大學學報·自然科學版雜志國內刊號為：11-2442/N，目前被北大期刊(中國人文社會科學期刊)、CSCD 中國科學引文數據庫來源期刊(含擴展版)、統計源期刊(中國科技論文優秀期刊)、知網收錄(中)、維普收錄(中)、萬方收錄(中)、EI 工程索引(美)、CA 化學文摘(美)、SA 科學文摘(英)、JST 日本科學技術振興機構數據庫(日)、Pж(AJ) 文摘雜志(俄)、國家圖書館館藏、上海圖書館館藏等收錄，獲得過全國優秀科技期刊、中國優秀期刊遴選數據庫、中國期刊全文數據庫（CJFD）、中科雙高期刊、中國科技期刊優秀期刊、北大圖書館收錄期刊、國家期刊提名獎期刊等榮譽。
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