新疆人民衛生出版社成立于1976年6月，是經新疆維吾爾自治區黨委、政府批準成立的地方性專業出版社，1977年元月國家新聞出版局予以注冊。由自治區衛生廳主辦、自治區新聞出版局主管的事業單位。1991年為順應全國出版社整改工作需要暫時改名為新疆科技衛生出版社。自2000年7月起為適應改革開放的要求，新疆科技衛生出版社變為差額補貼事業單位至今。2003年元月起社名恢復為新疆人民衛生出版社。

各種醫藥學類圖書（西醫，中醫，維吾爾醫方面等），普及科學基礎知識和應用科學技術類圖書；醫藥學、科技工具類圖書；介紹國內外先進科學技術；管理科學范例文獻；中小學輔導教材等科普類讀物。主要服務對象是農牧區群眾和在職醫務工作者，重點出版醫藥衛生類圖書、相關科技類圖書、各級醫藥衛生專業學校教材和相關教輔類圖書、社科類圖書。

自建社以來，新疆人民衛生出版社始終堅持為社會主義服務，為醫學教育、科研和醫療衛生服務的辦社宗旨，打造圖書精品，服務人民健康事業，堅持社會效益第一的原則，共出版醫學圖書2000余種，發行2000余萬冊。以“高質量、高品位、高水平、多層次”的品牌理念，成為社會信譽度很高的新疆衛生專業出版社，贏得了作者、讀者以及出版界的認可。

新疆人民衛生出版社被自治區衛生廳確立為“新疆衛生系統有突出貢獻單位”；70余種圖書獲省、自治區以上獎，曾獲“中國出版政府·圖書獎”，實現了社會效益和經濟效益的最佳結合。

新疆人民衛生出版社作為出版和編輯維吾爾古籍圖書的（國家公益性事業單位，醫學類專業圖書出版單位）機構，一直非常注重對維吾爾醫藥學傳統文化的挖掘、整理、編輯和出版，以期能使維吾爾醫藥學文化對各族人民的醫療保健事業的發展起到推動作用。但是民族醫藥文化的出版如果僅是停留在資料性的保存方面，而不是傳播出去，提升大眾對民族傳統文化的了解和興趣，那這種作用也就是十分有限的。為了傳承古代的傳抄傳統，我社決定對維吾爾醫學領域廣泛傳播的醫學著作進行重新整理，并以影印版形式出版。版面設計具有特色，完全不同于現行的版式設計風格與標準，能給讀者一種閱讀古代手稿的感受。

于1976年6月，經新疆維吾爾自治區人民政府批準，成立新疆人民衛生出版社。1990年2月新疆維吾爾自治區人民政府發函，社名改為新疆科技衛生出版社。